MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 chromosome

Total Repeats: 90379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007761	GAAC	2	8	483	490	50 %	0 %	25 %	25 %	86355670
2	NC_007761	GA	3	6	525	530	50 %	0 %	50 %	0 %	86355670
3	NC_007761	CCG	2	6	540	545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355670
4	NC_007761	GCCGC	2	10	546	555	0 %	0 %	40 %	60 %	86355670
5	NC_007761	CGAT	2	8	642	649	25 %	25 %	25 %	25 %	86355670
6	NC_007761	CGA	2	6	706	711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355670
7	NC_007761	ATCT	2	8	776	783	25 %	50 %	0 %	25 %	86355670
8	NC_007761	CGC	2	6	797	802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355670
9	NC_007761	TGA	2	6	822	827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355670
10	NC_007761	CG	3	6	841	846	0 %	0 %	50 %	50 %	86355670
11	NC_007761	GAC	2	6	878	883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355670
12	NC_007761	GAT	2	6	896	901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355670
13	NC_007761	GTC	2	6	917	922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355670
14	NC_007761	ATC	2	6	923	928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355670
15	NC_007761	ATCT	2	8	962	969	25 %	50 %	0 %	25 %	86355670
16	NC_007761	CAA	2	6	1044	1049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86355670
17	NC_007761	CCA	2	6	1074	1079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86355670
18	NC_007761	GAC	2	6	1120	1125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355670
19	NC_007761	GGA	2	6	1171	1176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86355670
20	NC_007761	CGC	2	6	1235	1240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355670
21	NC_007761	CGG	2	6	1254	1259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355670
22	NC_007761	TTG	2	6	1266	1271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86355670
23	NC_007761	TCG	2	6	1350	1355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355671
24	NC_007761	TCT	2	6	1393	1398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355671
25	NC_007761	CGA	2	6	1421	1426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355671
26	NC_007761	ACC	2	6	1615	1620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86355671
27	NC_007761	ATT	2	6	1849	1854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	86355671
28	NC_007761	CGAT	2	8	1912	1919	25 %	25 %	25 %	25 %	86355671
29	NC_007761	GAT	2	6	1921	1926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355671
30	NC_007761	CTGG	2	8	2211	2218	0 %	25 %	50 %	25 %	86355672
31	NC_007761	CCT	2	6	2226	2231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86355672
32	NC_007761	CCA	2	6	2237	2242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86355672
33	NC_007761	CGG	2	6	2309	2314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355672
34	NC_007761	CGG	2	6	2328	2333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355672
35	NC_007761	CGT	2	6	2388	2393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355672
36	NC_007761	GC	3	6	2465	2470	0 %	0 %	50 %	50 %	86355672
37	NC_007761	CATG	2	8	2481	2488	25 %	25 %	25 %	25 %	86355672
38	NC_007761	CTCG	2	8	2514	2521	0 %	25 %	25 %	50 %	86355672
39	NC_007761	ATGG	2	8	2524	2531	25 %	25 %	50 %	0 %	86355672
40	NC_007761	GCG	2	6	2536	2541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355672
41	NC_007761	CGT	2	6	2577	2582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355672
42	NC_007761	GTCG	2	8	2646	2653	0 %	25 %	50 %	25 %	86355672
43	NC_007761	TGC	3	9	2669	2677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355672
44	NC_007761	CGT	2	6	2721	2726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355672
45	NC_007761	GC	3	6	2739	2744	0 %	0 %	50 %	50 %	86355672
46	NC_007761	GCC	2	6	2971	2976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355673
47	NC_007761	CAG	2	6	3066	3071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355673
48	NC_007761	GCT	2	6	3107	3112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355673
49	NC_007761	GTC	3	9	3150	3158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355673
50	NC_007761	GC	3	6	3195	3200	0 %	0 %	50 %	50 %	86355673
51	NC_007761	TC	4	8	3233	3240	0 %	50 %	0 %	50 %	86355673
52	NC_007761	GCGCC	2	10	3266	3275	0 %	0 %	40 %	60 %	86355673
53	NC_007761	ATC	2	6	3333	3338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355673
54	NC_007761	ATC	2	6	3388	3393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355674
55	NC_007761	ACC	2	6	3406	3411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86355674
56	NC_007761	ATC	2	6	3436	3441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355674
57	NC_007761	CGG	2	6	3447	3452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355674
58	NC_007761	CGC	2	6	3588	3593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355674
59	NC_007761	CGA	2	6	3600	3605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355674
60	NC_007761	CTT	2	6	3615	3620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355674
61	NC_007761	GC	3	6	3685	3690	0 %	0 %	50 %	50 %	86355674
62	NC_007761	GGCGC	2	10	3741	3750	0 %	0 %	60 %	40 %	86355674
63	NC_007761	GC	3	6	3830	3835	0 %	0 %	50 %	50 %	86355674
64	NC_007761	GAT	2	6	3873	3878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355674
65	NC_007761	CGG	2	6	3879	3884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355674
66	NC_007761	GGC	2	6	3930	3935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355674
67	NC_007761	TTC	2	6	4190	4195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355675
68	NC_007761	ATC	2	6	4239	4244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355675
69	NC_007761	GCG	2	6	4246	4251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355675
70	NC_007761	GAT	2	6	4280	4285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355675
71	NC_007761	GCA	2	6	4336	4341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355675
72	NC_007761	CGC	2	6	4375	4380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355675
73	NC_007761	TCG	2	6	4504	4509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355675
74	NC_007761	TCG	2	6	4603	4608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355675
75	NC_007761	TGT	2	6	4618	4623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	86355675
76	NC_007761	TCC	2	6	4794	4799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86355676
77	NC_007761	ACC	2	6	4812	4817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86355676
78	NC_007761	GAC	3	9	4883	4891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355676
79	NC_007761	CGG	2	6	4931	4936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355676
80	NC_007761	AATGAG	2	12	4937	4948	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	86355676
81	NC_007761	GAT	2	6	4955	4960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355676
82	NC_007761	AGC	2	6	4989	4994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355676
83	NC_007761	CAG	2	6	5021	5026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355676
84	NC_007761	GCA	2	6	5098	5103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355676
85	NC_007761	CGA	3	9	5170	5178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355676
86	NC_007761	GCA	2	6	5203	5208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355676
87	NC_007761	TCA	2	6	5390	5395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355677
88	NC_007761	ATT	2	6	5397	5402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	86355677
89	NC_007761	TGG	2	6	5408	5413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86355677
90	NC_007761	CGG	2	6	5414	5419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355677
91	NC_007761	TCT	2	6	5426	5431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355677
92	NC_007761	GCTCC	2	10	5436	5445	0 %	20 %	20 %	60 %	86355677
93	NC_007761	GCC	2	6	5475	5480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355677
94	NC_007761	CGA	2	6	5571	5576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355677
95	NC_007761	GCG	2	6	5608	5613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355677
96	NC_007761	TGAA	2	8	5627	5634	50 %	25 %	25 %	0 %	86355677
97	NC_007761	GC	3	6	5640	5645	0 %	0 %	50 %	50 %	86355677
98	NC_007761	TCCT	2	8	5661	5668	0 %	50 %	0 %	50 %	86355677
99	NC_007761	GGC	2	6	5793	5798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355677
100	NC_007761	TCG	2	6	5843	5848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355677
101	NC_007761	CAGC	2	8	5919	5926	25 %	0 %	25 %	50 %	86355677
102	NC_007761	CG	3	6	6029	6034	0 %	0 %	50 %	50 %	86355677
103	NC_007761	ATG	2	6	6164	6169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355678
104	NC_007761	CGG	2	6	6179	6184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355678
105	NC_007761	GGA	2	6	6235	6240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86355678
106	NC_007761	CTT	2	6	6251	6256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355678
107	NC_007761	CGT	2	6	6279	6284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355678
108	NC_007761	GCG	2	6	6293	6298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355678
109	NC_007761	TGCC	2	8	6320	6327	0 %	25 %	25 %	50 %	86355678
110	NC_007761	ATCGG	2	10	6397	6406	20 %	20 %	40 %	20 %	86355678
111	NC_007761	GATC	2	8	6454	6461	25 %	25 %	25 %	25 %	86355678
112	NC_007761	TGGA	2	8	6489	6496	25 %	25 %	50 %	0 %	86355678
113	NC_007761	CGGC	2	8	6508	6515	0 %	0 %	50 %	50 %	86355678
114	NC_007761	GAC	2	6	6521	6526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355678
115	NC_007761	CGC	2	6	6551	6556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355678
116	NC_007761	GATC	2	8	6559	6566	25 %	25 %	25 %	25 %	86355678
117	NC_007761	TCT	2	6	6624	6629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355678
118	NC_007761	GCC	2	6	6647	6652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355678
119	NC_007761	GGCC	2	8	6703	6710	0 %	0 %	50 %	50 %	86355678
120	NC_007761	CTG	2	6	6734	6739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355678
121	NC_007761	CCGAG	2	10	6760	6769	20 %	0 %	40 %	40 %	86355678
122	NC_007761	CTGG	2	8	6793	6800	0 %	25 %	50 %	25 %	86355678
123	NC_007761	TTC	2	6	6854	6859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355678
124	NC_007761	GCG	2	6	6866	6871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355678
125	NC_007761	GCC	2	6	6902	6907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355678
126	NC_007761	CTT	2	6	6917	6922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355678
127	NC_007761	GCCG	2	8	6923	6930	0 %	0 %	50 %	50 %	86355678
128	NC_007761	GAT	2	6	7007	7012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	86355678
129	NC_007761	CGGC	2	8	7024	7031	0 %	0 %	50 %	50 %	86355678
130	NC_007761	TCG	2	6	7062	7067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355678
131	NC_007761	GC	3	6	7073	7078	0 %	0 %	50 %	50 %	86355678
132	NC_007761	GC	3	6	7117	7122	0 %	0 %	50 %	50 %	86355678
133	NC_007761	TCATCC	2	12	7152	7163	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	86355678
134	NC_007761	GCC	3	9	7169	7177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355678
135	NC_007761	CGC	2	6	7364	7369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355679
136	NC_007761	CAT	2	6	7420	7425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355679
137	NC_007761	GC	3	6	7480	7485	0 %	0 %	50 %	50 %	86355679
138	NC_007761	GTC	2	6	7522	7527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355679
139	NC_007761	CTC	2	6	7528	7533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	86355679
140	NC_007761	T	6	6	7536	7541	0 %	100 %	0 %	0 %	86355679
141	NC_007761	GC	3	6	7616	7621	0 %	0 %	50 %	50 %	86355679
142	NC_007761	GCC	2	6	7690	7695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355679
143	NC_007761	CAT	2	6	7699	7704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355679
144	NC_007761	CGG	2	6	7738	7743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355679
145	NC_007761	TC	3	6	7853	7858	0 %	50 %	0 %	50 %	86355680
146	NC_007761	CTG	2	6	7899	7904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355680
147	NC_007761	CAT	2	6	7928	7933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355680
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149	NC_007761	GTC	2	6	7986	7991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355680
150	NC_007761	GCC	2	6	8009	8014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355680
151	NC_007761	CGG	2	6	8046	8051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355680
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153	NC_007761	CGA	2	6	8390	8395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355681
154	NC_007761	GTC	2	6	8427	8432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355681
155	NC_007761	CGA	2	6	8444	8449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355681
156	NC_007761	CGTCAC	2	12	8474	8485	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	86355681
157	NC_007761	GGAT	2	8	8495	8502	25 %	25 %	50 %	0 %	86355681
158	NC_007761	CGAC	2	8	8536	8543	25 %	0 %	25 %	50 %	86355681
159	NC_007761	GCG	2	6	8551	8556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355681
160	NC_007761	TCA	2	6	8578	8583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355681
161	NC_007761	GGC	2	6	8601	8606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355681
162	NC_007761	CGG	2	6	8636	8641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355681
163	NC_007761	CGGCGT	2	12	8648	8659	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	86355681
164	NC_007761	CGT	2	6	8663	8668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355681
165	NC_007761	CCG	2	6	8702	8707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355681
166	NC_007761	TGGCG	2	10	8741	8750	0 %	20 %	60 %	20 %	86355681
167	NC_007761	AGC	2	6	8817	8822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355681
168	NC_007761	GAA	2	6	8946	8951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86355681
169	NC_007761	CGG	2	6	8963	8968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355681
170	NC_007761	AAG	2	6	9003	9008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86355681
171	NC_007761	TCG	2	6	9013	9018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355681
172	NC_007761	TGG	2	6	9075	9080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86355681
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177	NC_007761	AAAAGG	2	12	9217	9228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	86355681
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185	NC_007761	CGC	2	6	9483	9488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355681
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187	NC_007761	CCG	2	6	9586	9591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355681
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215	NC_007761	ACG	2	6	11097	11102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355682
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244	NC_007761	GA	3	6	13680	13685	50 %	0 %	50 %	0 %	86355684
245	NC_007761	CGT	2	6	13692	13697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355684
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247	NC_007761	ACG	2	6	13755	13760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355684
248	NC_007761	GCC	2	6	13989	13994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355685
249	NC_007761	CGC	2	6	14009	14014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355685
250	NC_007761	CAT	2	6	14021	14026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	86355685
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252	NC_007761	CAC	2	6	14114	14119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	86355685
253	NC_007761	CGC	2	6	14121	14126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355685
254	NC_007761	GCCGC	2	10	14254	14263	0 %	0 %	40 %	60 %	86355685
255	NC_007761	TCG	2	6	14281	14286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355685
256	NC_007761	GCT	2	6	14312	14317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355685
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258	NC_007761	CGA	2	6	14417	14422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	86355685
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260	NC_007761	CGGTGC	2	12	14497	14508	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	86355685
261	NC_007761	GGA	2	6	14528	14533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	86355685
262	NC_007761	GGC	2	6	14574	14579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355685
263	NC_007761	CGG	2	6	14605	14610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355685
264	NC_007761	CAA	2	6	14612	14617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	86355685
265	NC_007761	CGT	2	6	14759	14764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	86355685
266	NC_007761	TTC	2	6	14778	14783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	86355685
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270	NC_007761	CGG	2	6	14956	14961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355685
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393	NC_007761	GGT	2	6	20712	20717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	86355692
394	NC_007761	CGG	2	6	20781	20786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355692
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498	NC_007761	CGG	2	6	25194	25199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	86355694
499	NC_007761	CGC	3	9	25233	25241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	86355694
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